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Palabras clave
Gastric biopsies
Evolution
Population structure
Genome
Gastric lesions (DeCS/MESH) Acervo genético
Biopsias gástricas
Evolución
Estructura de población
Genoma
lesiones gástricas (DeCS/MESH)
Cómo citar
Resumen
Objetivo: Determinar la ancestría de Helicobacter pylori aislado de pacientes provenientes de una zona de alto riesgo de cáncer gástrico del departamento de Nariño. Materiales y Métodos: Se incluyeron 16 pacientes con síntomas de dispepsia e infectados con Helicobacter pylori. Se utilizaron biopsias gástricas para el cultivo de Helicobacter pylori y subsecuente secuenciación del genoma total por Illumina MiSeq, 2x300 pb. El ensamblaje y anotación de los genomas se procedió mediante el uso de los algoritmos SPAdes y RASTtk. Las proporciones ancestrales de Helicobacter pylori se determinaron por STRUCTURE con el modelo de mezcla. Las diferencias entre estas proporciones se establecieron con las pruebas H de Kruskal Wallis y post hoc. Resultados: La estructura de la población de Helicobacter pylori deriva de cuatro poblaciones ancestrales: Ancestral Europa (AE) (61.2%), Ancestral Africa1 (AA1) (35.7%), Ancestral Este de Asia (AEA) (3%) y Ancestral Africa2 (AA2) (0.1%), siendo significativas las diferencias entre las proporciones de los ancestros de Helicobacter pylori (p<0.05). Se identificaron diferencias estadísticamente significativas entre: AA2 y AEA (p=0.022); AA2 y AA1 (p<0.05); AA2 y AE (p<0.05); AEA y AA1 (p=0.014) y AEA con AE (p<0.05), sin embargo, no se encontró diferencias significativas entre AA1 y AE (p=0.098), evaluadas por post hoc. Conclusión: Helicobacter pylori que coloniza la mucosa gástrica de una población de alto riesgo de cáncer gástrico en Nariño, deriva su acervo genético principalmente de ancestros europeos y africanos, confiriéndole a la bacteria alta capacidad competitiva asociada al desarrollo de lesiones severas en nichos gástricos amerindios.
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